No es raro que muchas veces al intentar actualizar Manjaro (que proviene de Arch) me de problemas del tipo ¿Desea desinstalar mesa-drivers? ¿xorg? ¿systemd? Obviamente este tipo de paquetes hay que tener cuidado de no quitarlos, son bastante esenciales para nuestro sistema.
Así que si da problemas, ejecutamos lo siguiente, que consiste en que actualiza los paquetes nuevos y otro tipo de información.
$ sudo pacman -Syyu
o incluso también
$ sudo pacman -Syyuu